Seit Beginn des Schuljahres 1997/1998 ist das Leibniz-Gymnasium Seminarschule für die Fächer Deutsch, Englisch, Französisch, Spanisch, Sport weiblich, Erdkunde und Wirtschaftswissenschaften.

Mit dem Schuljahr 1997/98 begann für das Leibniz-Gymnasium ein wichtiger Abschnitt in der Schulgeschichte: Der Seminarbetrieb, das heißt die Ausbildung von zukünftigen Lehrerinnen und Lehrern, wurde zu diesem Termin in vollem Umfang aufgenommen, nachdem zuvor schon mehrere Jahre lang Fachseminare für Sport weiblich und Wirtschaftswissenschaften an der Schule angesiedelt waren.

Zum Schuljahr 2005/06 wurden zwei neue Studienseminare für Mathematik und Physik eröffnet, womit neben der sprachlichen Ausrichtung nun auch der naturwissenschaftlich-technologische Zweig des Gymnasiums repräsentiert ist.

Damit werden nun am Leibniz-Gymnasium angehende Lehrerinnen und Lehrer in den Seminarfächern Deutsch, Englisch, Französisch, Spanisch, Geographie, Wirtschaftswissenschaften, Mathematik und Physik ausgebildet. Daneben treten als Grundlagenfächer Pädagogík, Psychologie, Schulkunde und Grundfragen der staatsbürgerlichen Bildung.

Das momentane "Hausseminar" hat mit dem Schuljahresbeginn im September 2009 seine Ausbildung aufgenommen und wird nun in den einzelnen Fachseminaren theoretisch und im praktischen Unterrichtseinsatz in den Lehrerberuf am Gymnasium eingeführt.

Die Damen und Herren des "Außenseminars" haben ihren ersten Ausbildungsabschnitt im Februar 2010 abgeschlossen und befinden sich zur Zeit im sogenannten Zweigschuleinsatz an Gymnasien in ganz Bayern, wo sie weitere praktische Unterrichtserfahrungen sammeln. Dieser Einsatz wird von fünf „Seminartagen" unterbrochen, zu denen die Referendare sich zur theoretisch-didaktischen Weiterschulung wieder in ihrer Stammschule in Altdorf einfinden.